Durante la II Guerra Mundial Japón quedó dividida en dos partes. En el Aomori, controlado por las fuerzas de EE.UU. viven dos jóvenes, Hiroki y Takuya, siendo sus mayores intereses Sayuri, y una gigantesca, misteriosa torre visible en el horizonte de Hokkaido bajo el dominio de la Unión Soviética. Un día deciden construir su propio aeroplano y volar hasta la torre, pero antes de que puedan empezar Sayuri y Hiroki son transferidos a diferentes colegios en el Tokyo distante. Tres años después, Sayuri entra en un estado de coma profundo y ellos entienden que la única manera de ayudarla, y probablemente de incluso salvar el mundo, es cumplir la promesa de cuando eran chicos

Plusieurs petites filles sont torturées puis sauvagement tuées dans leur école. Plusieurs années après, cette école a été détruite et un lycée a vu le jour, le lycée Kisaragi. C’est le jour du festival culturel de l’école. Élève de la classe 2-9, Mayu Suzumoto vit son dernier jour dans cet école avant son soudain transfert. Quelques amis de classe décide de fêter son départ. Pour cela, Ayumi Shinozaki décide de faire un charme en forme de poupée en papier qui unira pour l’éternité tout ce petit monde. Une fille du nom de Sachiko « apparaît ». Qui est-elle ? Et surtout, que veut-elle ?