El mundo Entero esta siendo dominado por una enfermedad mortal, esto convierte a los humanos en zombies. En Japón muchos estudiantes de la preparatoria Fujimi, y la enfermera de la escuela, estarán juntos tratando de sobrevivir al presente Apocalipsis. La historia se centra en Takashi Komuro, uno de los estudiantes que ha sobrevivido a esta grave enfermedad.

Alors qu’il sèche les cours, Takashi assiste, impuissant, à l’invasion de son lycée par ce qui semble être des morts-vivants. Réussissant à former un petit groupe de survivants, incluant Reï, son amie d’enfance, il tente d’échapper à la contamination, mais se rend vite compte que le monde entier est touché. Commence alors une longue bataille pour sa survie et celle de ses nouveaux camarades dans une ville de Tôkyô infestée de zombies.

De longues années après la fin du premier Gunbuster, les aliens réapparaissent. Au même moment, certains humains naissent avec des pouvoirs psychiques spéciaux: les Topless. Réunis dans une organisation dénommée la Fraternité, eux seuls peuvent contrôler un nouveau type de robots, les Gunbusters. Nono, une jeune fille sensible, rêve de devenir pilote spatiale. Ce film produit en 2006 par le studio GAINAX est un montage de la série d'OAV Diebuster (Gunbuster 2, 2004) pour une exploitation au cinéma.

Cela fait plus d’une décennie que les adolescents du monde entiers s’abonnent pour jouer au célèbre MMORPG The World. Sora Yuki est une jeune fille âgée de 14 ans qui aime passer du temps en compagnie de ses deux meilleures amis. Tout comme de nombreux ados, les meilleurs amis de Sora sont fascinés par The World et son univers fantaisiste cependant Sora ne partage pas cette passion.Afin de lui faire changer d’avis, les amis de Sora décideront de l’initier à The World. Très rapidement les deux meilleurs amis de Sora s’aperçoivent que la jeune fille se révèle être une joueuse douée et compétente. Au cours d’une de leur partie, Sora et ses amis constatent qu’un étrange bug se propage dans The World. Ce même bug serait apparemment responsable de l’apparition de phénomènes étrange dans le monde réel. Notre trio décidera alors d’enquêter dans The World ainsi que dans le monde réel pour contrer ce mystérieux bug.

Tras recomponerse de un duro golpe, Simon, Yoko y la Gran Brigada Gurren se preparan para la batalla final contra las fuerzas del Rey Espiral que decidirá el futuro de la humanidad. Pero, siete años más tarde,¿será ese futuro tal y como lo habían soñado? Atrapados bajo el peso de la responsabilidad de administrar el nuevo mundo, los miembros de la Brigada de aburren. Pero todo cambia cuando la primera nave a la Luna activa el plan de exterminio humano de los Anti Espirales. Cuando toda esperanza parece perdida, la Gran Brigada Gurren vuelve a los mandos de sus robots gigantes para librar una guerra a una escala sin precedentes y abrir un nuevo camino hacia el futuro.

Simon habita en la aldea subterránea de Yeeha cavando túneles para expandir el pequeño mundo subterráneo al que ha sido condenado la humanidad. Un día, encuentra un minúsculo taladro que activa un pequeño robot y su mundo se viene literalmente abajo cuando irrumpe en él un monstruo gigante. Arrastrado a la superficie por su "hermano" Kamina, el apasionado líder de la brigada Gurren, ambos deciden rebelarse contra los hombres bestia que dominan la superficie con la ayuda de la exuberante tiradora Yoko. En su enfrentamiento contra todo tipo de robots gigantes exterminadores de humanos encontrarán numerosos aliados a los que inspirarán en el camino de la revolución.