Durante la II Guerra Mundial Japón quedó dividida en dos partes. En el Aomori, controlado por las fuerzas de EE.UU. viven dos jóvenes, Hiroki y Takuya, siendo sus mayores intereses Sayuri, y una gigantesca, misteriosa torre visible en el horizonte de Hokkaido bajo el dominio de la Unión Soviética. Un día deciden construir su propio aeroplano y volar hasta la torre, pero antes de que puedan empezar Sayuri y Hiroki son transferidos a diferentes colegios en el Tokyo distante. Tres años después, Sayuri entra en un estado de coma profundo y ellos entienden que la única manera de ayudarla, y probablemente de incluso salvar el mundo, es cumplir la promesa de cuando eran chicos

Cross Road se déroule quelques années après l'histoire de Miss Lonely Yesterday. Théo a terminé l'université et a décidé de partir aux USA pour "trouver son baseball" et ainsi se démarquer définitivement du style de jeu de son frère jumeau Kim, victime d'un accident de voiture, et qui est resté dans les mémoires des journalistes et du public. Théo débute en professionnel chez les Emeralds, une équipe de niveau A (4ème division) avec de faibles moyens financiers... Cette division est le passage obligatoire pour tout joueur espérant monter dans les divisions supérieures (double A et triple A) et voire même atteindre la "Ligue majeure". Théo y découvre des joueurs de tous horizons et avec des motivations différentes. Il faut faire ses preuves dans cette équipe et être capable de tenir le rythme des 145 matchs de la saison.

Takao, quien está entrenando para convertirse en un zapatero, se salta la escuela para dibujar zapatos en un jardín de estilo japonés, un día se encuentra con una misteriosa mujer, Yukino, que es mayor que él. Los dos se comienzan a ver una y otra vez, pero sólo en días de lluvia. Con el tiempo ellos empiezan a profundizar su relación y a abrirse el uno al otro. Pero el final de la temporada de lluvias está muy cerca...

Planeta Tierra: el futuro. Los únicos humanos que quedan son clones. Retro, un joven que, por alguna razón, tiene un televisor en lugar de cabeza y Pandy, una chica con una mancha de nacimiento sobre su ojo derecho, escapan de la policía. Capturados por las fuerzas del orden, son encarcelados en la colonia penitenciaria lunar llamada "Dead Leaves". Pronto se dan cuenta de que no están como para aguantar el régimen brutal de la prisión, así que comienzan a planear su huida, comenzando así una aventura violenta, caótica, esperpéntica y rocambolesca.