Kaitou Kid envía una advertencia a Miss Judie diciendo que quiere robarle su preciado anillo. Judie le pide ayuda a Kogoro Mouri y cuando él, Ran, Sonoko, Conan, Ai, Agasa y los Jóvenes Detectives van a visitarla al teatro coinciden con el inspector Nakamori, quien no no viene solo: ¡Shinichi le acompaña! Conan sabe que Shinichi es Kaitou Kid disfrazado, pero nada puede hacer al respecto. Después, todos abordan un avión y vuelan a Sapporo. Judie los invita para agradecerles por proteger el anillo. Judie visita a los pilotos, y cuando vuelve cae muerta. Ha sido envenenada. De repente, los pilotos también han sido envenenados, así que tienen que aterrizar el avión ellos mismos. Y Kid parece estar también entre los pasajeros ¿Podrá Conan atrapar a Kid y salvarlos de estrellarse?

La historia tiene lugar en un restaurante submarino llamado 'Aqua Crystal' que se asemeja a una base espacial futurista. Los invitados que se han dado cita en el restaurante desconocen que su vida está en peligro y que están amenazados por un loco asesino en serie. Este psicópata asesino cumple sus planes de forma impecable y ordenada. Después de cada asesinato deja, a propósito, una carta cuyo número siempre coincide con el nombre de la víctima.

En el clímax de las Guerras Eva, el 24 de diciembre del año AC 195, los ejércitos de la Nación Mundial y el Colmillo Blanco se enfrentaron en una feroz batalla. El líder de la Nación Mundial, Treize Khushrenada, fue asesinado, el líder del Colmillo Blanco, Zechs Merquise, desapareció y la Tierra fue salvada de la destrucción por la intervención de los cinco pilotos de Gundam. Habiendo presenciado las consecuencias de la guerra y el odio, la gente de la Tierra y las colonias espaciales dejaron de lado sus diferencias y juntos fundaron un nuevo gobierno mundial.

Conan viaja a Singapur, concretamente a la famosa Marina Bay Sands, escenario en el que se ha producido un cruento asesinato. La investigación parece girar en torno a una gema legendaria conocida como 'Zafiro Azul', que lleva sumergido en el océano desde finales del siglo XIX. Makoto Kyôgoku ayudará al joven detective a detener a Kaitō Kid, quien quiere robar la tan preciada joya.

Lupica, otra princesa que parece haber descubierto la existencia del planeta Tierra en alguna guía turística, aparece y abduce a Ataru. Pero Lupica no está detrás de Ataru por su gran estilo o su encantadora personalidad (más que nada porque no tiene ninguna de las dos). La meta de Lupica es la mayor poción de amor de la galaxia, la cual pretende usar para hacer que su cariñito se case con ella. Para conseguir dicha poción, necesita al posesor de la mayor lujuria del universo...

Guy et Dena se présentent comme des agents spatiaux. Ils sont tous deux partenaires de travail. Ils sont souvent sans le sou et accumulent les missions pour joindre les deux bouts. Les deux compères sont complémentaires. Dena est davantage douée pour les infiltrations et le recueil des renseignements. Tandis que Guy, qui est un solide gaillard, s'occupe des « basses besognes » en réglant les problèmes de front. Mais certaines de leurs aventures vont profondément bouleverser leur quotidien.

Aparentemente destruidos durante la Segunda Guerra Mundial, uno de los Girasoles de Van Gogh resurge en una subasta en Nueva York. El grupo financiero Suzuki gana la puja y aprovecha la oportunidad para anunciar una exposición sobre los Girasoles completa, cuando el ladrón Kaito Kid declara el último objetivo de su atraco: Los Girasoles.

Un anciano líder de una lejana galaxia, recuerda en el momento de su muerte las extrañas circunstancias que le convirtieron de un humilde aldeano, en el héroe admirado por todos... Menos por él mismo, ya que sólo él sabe porque se destruyó toda una civilización y quién fue el culpable de ello.