Dans les quartiers souterrains secrets de BABYCO, le leader des produits de petite enfance, son fondateur et pdg, la célèbre psychiatre pour enfants Dr. Elena Kinder (Kathleen Turner), est sur le point de récolter les fruits d'années de recherche. Certains enfants sont nés des génies, des prodiges nés avec une sagesse au delà de leurs années et qui, autour de deux ans, perdent leur intelligence extraordinaire lorsqu'ils commencent à communiquer avec les adultes. Si ses découvertes pourraient lui obtenir un prix Nobel, Dr. Kinder et son associé estimé Heep (Christopher Lloyd) ont d'autres idées en tête : comprendre la source de puissance du cerveau des nouveau-nés et des bébés et utiliser l'énergie en résultant pour assurer leur propre puissance et richesse personnelles. Une seule chose fait obstacle à la domination mondiale de Dr. Kinder, un petit garçon très intelligent de deux ans, Sly.